即使亲子鉴定结果表明不是父子关系，也仍然可以办理出生证明，但出生证明上的父亲信息可能需要根据实际情况进行调整。以下是具体的分析：

一. 出生证明与亲子鉴定的关系

1. 出生证明的定义：出生证明是记录新生儿出生情况的重要法律文件，通常包括新生儿的姓名、性别、出生日期、出生地点以及父母信息等。
2. 亲子鉴定的作用：亲子鉴定是通过科学手段确定两个人之间是否存在亲子关系的一种检测方式。其结果可以作为法律上的证据，用于解决亲子关系相关的争议。
3. 两者关系：出生证明的办理并不直接依赖于亲子鉴定结果。即使亲子鉴定结果表明不是父子关系，也不妨碍出生证明本身的办理。但出生证明上的父亲信息可能需要根据亲子鉴定结果进行调整，以确保信息的准确性。

二. 出生证明的办理

1. 办理机构：根据《中华人民共和国母婴保健法》第二十三条，医疗保健机构和从事家庭接生的人员负责出具新生儿出生医学证明。
2. 办理要求：出生证明的办理通常要求提供新生儿的出生信息以及父母的相关信息。在特殊情况下，如亲子鉴定结果表明不是父子关系，可能需要提供额外的证明材料或说明情况。

三. 实际操作建议

1. 如实申报：在办理出生证明时，应如实申报新生儿的出生情况以及父母信息。如果亲子鉴定结果表明不是父子关系，应如实向办理机构说明，并根据实际情况调整出生证明上的父亲信息。
2. 法律咨询：如果涉及复杂的法律问题或争议，建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。

综上所述，即使亲子鉴定结果表明不是父子关系，也仍然可以办理出生证明。但在办理过程中，应如实申报相关信息，并根据实际情况调整出生证明上的父亲信息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。