由父亲办理出生证明亲子鉴定是可以的，但还需要结合其他证明材料。具体分析如下：

一. 出生证明办理的相关规定

在不同的地区，对于由父亲办理出生证明并需要进行亲子鉴定的情况，有具体的法律规定。例如：

1. 广东省的相关规定：根据《广东省卫生健康委广东省公安厅关于出生医学证明的管理办法》，若新生儿母亲不申领或者信息无法核实，可以由新生儿父亲申领出生医学证明。此时，需要新生儿父亲现场申领，并提供申请方签字的书面说明以及新生儿与父亲的亲子司法鉴定意见书。

2. 上海市的相关规定：上海市的《出生医学证明》管理办法规定，若无法提供新生儿母亲合法有效身份证件原件，属于无法核定母亲信息的新生儿，则不能获得《出生医学证明》。在这种情况下，签发机构应出具《无法签发<出生医学证明>的证明》。

二. 亲子鉴定在办理出生证明中的作用

• 亲子鉴定是证明新生儿与父亲亲子关系的重要法律依据。在母亲无法配合办理出生证明的情况下，通过亲子鉴定可以确认父亲与孩子的亲子关系，从而为孩子办理出生证明提供必要的法律支持。

三. 办理流程与所需材料

• 父亲在办理出生证明时，除了需要提供亲子鉴定意见书外，还可能需要根据当地的具体规定提供其他相关证明材料，如申请方签字的书面说明、父亲的身份证件等。
• 办理流程通常包括向当地卫生健康行政部门或指定的出生医学证明签发机构提交申请材料，并等待审核和签发。

综上所述，由父亲办理出生证明并进行亲子鉴定是可以的，但还需要根据当地的具体法律规定提供其他必要的证明材料。我建议你在办理前咨询当地的卫生健康行政部门或出生医学证明签发机构，了解具体的办理流程和所需材料，以确保能够顺利为孩子办理出生证明。如有进一步需要，您可以继续咨询我。