以物抵债协议中，若房屋所有权不确定，该协议的有效性需视具体情况而定。

1. 协议可能有效的情形：

   • 如果双方当事人在签订以物抵债协议时，均知晓并同意房屋所有权存在不确定性，且该不确定性不影响协议的履行，那么协议在双方真实意思表示下，仍有可能被认定为有效。但此情况下，双方应明确约定如何处理房屋所有权确定后的相关事宜，以避免后续纠纷。

2. 协议可能无效或可撤销的情形：

   • 所有权争议：如果房屋所有权存在明确争议，且该争议可能导致协议无法履行或履行后产生纠纷，那么协议可能因标的物不确定而被认定为无效。
   • 欺诈、胁迫或重大误解：如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫或重大误解，导致另一方对房屋所有权状况产生错误认识，那么受损害方有权请求撤销协议。
   • 违反法律法规：如果协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，如涉及非法土地流转等，那么协议将无效。

3. 特殊情况的考虑：

   • 如果债权人在签订协议时知道或应当知道债务人有其他债权人，且协议可能损害其他债权人利益，那么协议的有效性可能会受到质疑。
   • 如果房屋所有权在协议签订后确定，且确定的结果与协议约定不符，那么协议双方应根据实际情况协商处理，或依法通过诉讼等方式解决纠纷。

综上所述，以物抵债协议中房屋所有权的不确定性会影响协议的有效性。因此，在签订此类协议时，双方应充分了解房屋所有权的状况，并明确约定相关事宜，以避免后续纠纷。如果协议已经签订且存在纠纷，建议双方协商处理或依法通过诉讼等方式解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。