在总包恶意欠款的情况下，发包方确实负有一定的监督款项的责任。以下是对此问题的详细分析：
一. 发包方的监督责任
- 连带责任：根据《中华人民共和国民法典》第七百九十一条，总承包人或者勘察、设计、施工承包人经发包人同意，可以将自己承包的部分工作交由第三人完成。第三人就其完成的工作成果与总承包人或者勘察、设计、施工承包人向发包人承担连带责任。这意味着，如果总包恶意欠款，分包单位无法支付款项时，发包方在某种程度上需要承担连带责任，因为其对总包的付款行为负有一定的监督责任。
- 监督义务：虽然法律没有明确规定发包方必须直接监督每一笔款项的支付，但作为工程项目的发包方，其有义务确保工程项目的顺利进行，包括工程款项的按时支付。如果发包方未能尽到合理的监督义务，导致总包恶意欠款，发包方可能需要承担相应的法律责任。
二. 实际操作中的建议
- 明确合同条款：在签订建设工程合同时，发包方应明确约定工程款项的支付时间、方式以及违约责任等条款，以确保总包方能够按时支付款项。
- 加强监督与管理：发包方可以定期对工程项目的进展和款项支付情况进行检查，确保总包方按照合同约定履行付款义务。
- 及时采取措施：如果发现总包方存在恶意欠款行为，发包方应及时采取措施，如与总包方进行协商、催促付款或采取法律手段等，以维护自身的合法权益。
综上所述，在总包恶意欠款的情况下，发包方确实负有一定的监督款项的责任。因此，我建议发包方在签订合同时应明确相关条款，并加强对工程款项的监督与管理，以确保工程项目的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。