工程签证单在计算工日时，通常是以实际发生的、与工程相关且经过确认的工作时间为依据。具体来说：

一. 工程签证单与工日的关系

1. 工程签证单的定义：工程签证单是施工过程中，对实际发生的、与工程相关且需要额外计费或确认的事项进行书面记录的单据。它通常包括工作内容、工作量、工作时间、费用等信息。
2. 工日的计算：工日是指一个工人工作一天的时间，通常按照8小时计算。在工程签证单中，如果记录了某项工作需要额外的工作时间，且该时间被确认为有效工作时间，那么这部分时间就可以计入工日。

二. 工程签证单算工日的情况

1. 额外工作：如果工程签证单记录的是因工程变更、增加工作量或其他原因导致的额外工作，且这些工作确实需要额外的时间来完成，那么这部分时间就可以计入工日。
2. 停工待料：如果因材料供应不及时等原因导致工程停工，且停工时间被记录在工程签证单中，并经过确认，那么这部分停工时间也可以计入工日，但通常需要按照合同约定或行业惯例进行折算。
3. 其他情况：根据工程实际情况和合同约定，还有其他可能计入工日的情况，如因天气原因导致的停工、因设备故障导致的停工等，只要这些情况被记录在工程签证单中并经过确认，就可以计入工日。

三. 注意事项

1. 确认程序：工程签证单中的工作时间需要经过相关人员的确认，如项目经理、监理等，以确保其真实性和有效性。
2. 合同约定：在计算工日时，还需要考虑合同中的相关约定，如工日的计算方法、折算规则等。
3. 证据留存：为了避免后续争议，建议保留好工程签证单原件及相关证据材料。

我的观点：工程签证单在计算工日时，应严格依据实际发生的工作时间和合同约定进行。如果有任何疑问或争议，应及时与相关人员沟通并寻求解决方案。如有进一步需要，您可以继续咨询我。