对于农村宅基地上的违建问题，其处理方式及合法化途径主要遵循《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国城乡规划法》及相关地方性法规。以下是对该问题的详细解答：
一、违建的认定
- 未取得规划许可：若建筑未取得乡村建设规划许可证，或虽取得但未按许可证规定建设（如改变位置、超面积等），则被视为违法建筑。
- 违反土地用途：宅基地应用于住宅建设，若擅自改变用途（如建工厂、养殖场等）或未经批准占用农用地，同样属于违法建筑。
- 其他违规情形：包括超过批准期限的临时建筑未拆除、非法转让宅基地后建设、占用公共用地或影响公共安全等。
二、处理方式
- 责令停止建设：一旦发现违建，乡、镇人民政府将立即责令停止建设，防止违法情况扩大。
- 限期改正：对于情节较轻且可改正的违建，将责令限期改正，如拆除超建部分、补办审批手续等。改正后，建筑可合法化。
- 限期拆除：对于严重违反规划或土地管理规定的违建，将责令限期拆除。若逾期不拆除，乡、镇人民政府可依法组织强制拆除。
- 罚款与没收：根据违建情况，相关部门可能对违建者处以罚款，或没收违法建筑及违法所得。
- 追究刑事责任：若违建行为涉嫌犯罪，如非法占用农用地罪，将依法追究刑事责任。
三、特殊情况处理
- 历史遗留问题：对于《城乡规划法》实施前的宅基地建房等历史遗留问题，多地采取“确权补办手续”方式处理。符合条件的农民可补办建设手续，使建筑合法化。
- 保障基本住房：处理违建时，应优先保障农民的基本住房需求。对于无房户、危房改造等特殊情况的农户，应提供合理的解决方案。
四、当事人权利保障
- 陈述和申辩：违建者有权在整个处理过程中向相关部门陈述和申辩，争取合理处理结果。
- 行政复议和诉讼：对违建认定或处罚不服的，违建者可在规定时间内申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
五、建议与总结
- 遵守法规：农民在进行宅基地建设时，应严格遵守相关法律法规，确保建设的合法性。
- 及时咨询：若对建设规定有疑问或不确定，应及时咨询当地乡、镇人民政府或相关部门，避免违规建设。
- 积极配合：一旦建筑被认定为违建，应积极配合相关部门的处理工作，及时改正或拆除，以减轻法律后果。
综上所述，农村宅基地上的违建问题需依法依规处理。农民朋友在进行建设时，应严格遵守法律法规，确保建筑的合法性；同时，对于历史遗留问题或特殊情况，也应积极寻求合法化的途径。