经批准自动离职与经批准辞职的主要区别在于两者的性质、流程以及法律后果。

1. 性质差异：

   • 经批准自动离职：这通常指的是劳动者在未经用人单位事先批准或者未按既定离职程序提交书面申请的情况下，但后续可能得到了用人单位的追认或批准，从而视为合法离职。然而，严格意义上，“自动离职”本身带有不合规的意味，因为它违背了正常的离职程序。
   • 经批准辞职：这是劳动者主动向用人单位提出解除劳动合同或劳动关系的请求，并且这一请求得到了用人单位的批准。辞职是合法且严谨的行为方式，双方可以根据法律法规以及劳务合同中的具体条款，妥善处理好相关事务。

2. 流程差异：

   • 自动离职：劳动者可能先自行脱离工作岗位，随后用人单位可能根据实际情况进行追认或处理。这种流程往往不够规范，容易引发劳动纠纷。
   • 辞职：劳动者需要按照用人单位制定的标准化流程来提交辞职申请，并等待用人单位的批准。这一流程通常更加明确和规范，有助于减少劳动纠纷的发生。

3. 法律后果差异：

   • 自动离职：由于自动离职本身带有不合规的意味，劳动者可能会因此遭受诸多负面影响，如受到旷工惩处、无法领取尚未结清的薪资待遇等。即使后续得到了用人单位的追认或批准，这些负面影响也可能已经产生并难以消除。
   • 辞职：辞职是合法且受保护的行为。劳动者在辞职后可以依法获得相应的经济补偿（如经济补偿金、未休年假补偿等），并且不会因辞职而遭受不公正的待遇或处罚。

综上所述，经批准自动离职与经批准辞职在性质、流程以及法律后果等方面存在显著差异。建议劳动者在离职时务必遵循正规的辞职流程，以确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。