工程总承包设计中的设计部分通常不可以单独结算，而是作为整个工程总承包项目的一部分进行统一结算。以下是对此问题的详细分析：

一. 工程总承包的结算原则

1. 整体性原则：工程总承包通常包括设计、施工、采购等多个环节，这些环节构成一个完整的工程项目。因此，结算时通常考虑的是整个项目的成本、进度和质量，而不是单独某个环节。
2. 合同约定：根据《中华人民共和国建筑法》及相关法律法规，工程总承包的结算方式、标准和时间等应在合同中明确约定。如果合同中没有特别约定设计部分可以单独结算，那么设计部分就应当作为整个项目的一部分进行统一结算。

二. 设计部分在总承包中的地位

1. 设计是总承包的重要组成部分：设计是工程总承包项目的前端环节，对后续的施工、采购等环节具有指导和约束作用。因此，设计的质量和进度直接影响整个项目的实施。
2. 设计与施工、采购的关联性：在工程总承包项目中，设计、施工、采购等环节往往相互关联、相互影响。单独结算设计部分可能会打破这种关联性，导致项目管理的混乱和成本的增加。

三. 实际操作中的考虑

1. 便于管理：统一结算整个工程总承包项目有利于项目管理方对项目的整体把控，包括成本、进度和质量等方面。
2. 避免纠纷：单独结算设计部分可能会引发承发包双方之间的纠纷，因为设计部分的成本和质量往往难以单独量化和评估。统一结算可以减少这种纠纷的发生。

综上所述，我建议在实际操作中，工程总承包设计通常不应单独结算，而是应作为整个工程总承包项目的一部分进行统一结算。这样做既符合工程总承包的结算原则，又有利于项目管理的便捷性和高效性。当然，如果承发包双方在合同中有特别约定，或者根据实际情况确实需要单独结算设计部分，那么也可以根据实际情况进行灵活处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。