员工贪污公款后赌博输掉的钱，在理论上是有可能被追回的，但具体能否追回以及追回的程度取决于多种因素。以下是对此问题的详细分析：
一. 追回钱款的可能性与途径
公司角度的追款方式：
- 内部调查与协商：公司首先应进行内部调查，确认贪污行为及金额。若员工承认贪污并愿意偿还，且具备偿还能力，公司可通过协商要求其归还贪污的款项。
- 法律途径追款：若协商无果或员工不具备偿还能力，公司可向公安机关报案，请求司法机关介入。一旦立案侦查，若贪污行为构成犯罪，司法机关将依法追究员工的刑事责任。在此过程中，公司可作为被害人，通过刑事附带民事诉讼或单独提起民事诉讼，要求员工承担民事责任，返还被贪污的资金。
司法机关追缴违法所得：
- 司法机关在办理贪污案件时，会依法追缴违法所得。若贪污的资金仍存在，如存入银行账户或购买财产，司法机关将冻结、查封、扣押这些财产，并在案件审结后返还给公司。
- 若资金已被挥霍或与其他合法财产混同，追缴工作可能面临困难。但司法机关会尽力追查资金流向，争取最大限度地挽回公司损失。
法律程序与措施：
- 检察院对贪污案件立案侦查后，可采取一系列侦查措施，包括查询、冻结犯罪嫌疑人的存款、汇款等财产。
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，司法机关有权采取多种强制措施，以确保案件的顺利侦办和赃款的追回。
二. 贪污公款赌博的法律后果
刑事责任：
- 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，员工贪污公款构成贪污罪，将面临严厉的刑事处罚。具体刑期根据贪污数额和情节严重程度而定。
- 员工赌博输掉的钱，作为违法所得的一部分，将被司法机关追缴。
民事责任：
- 员工即便承担了刑事责任，也不免除其民事责任。服刑期满后，仍有义务归还被贪污的公款。
三. 影响追回钱款的关键因素
- 员工的偿还能力：若员工无力偿还，即使公司通过法律途径获得胜诉判决，也可能无法实际追回款项。
- 公司的证据保留情况：公司需及时发现贪污行为，并保留好相关证据，如财务记录、资金流向证明等，以确保在追款过程中有足够证据支持。
- 司法机关的侦查力度：司法机关的侦查效率和力度直接影响案件的进展和追回钱款的可能性。
综上所述，员工贪污公款后赌博输掉的钱在理论上是可以追回的，但实际操作中需综合考虑多种因素。同时，贪污和赌博都是违法行为，将受到法律的严厉制裁。因此，建议公司和员工都应严格遵守法律法规，避免类似行为的发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。