村民小组长侵占集体土地，村民仍然有权起诉。针对您提出的问题，以下是从法律角度进行的详细分析：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国土地管理法》明确规定，村集体土地的所有权归集体所有，村民作为集体的一员，对村集体土地享有合法的权益。当土地被侵占时，村民有权依据该法律提起诉讼，要求侵权人停止侵害、返还土地。
   • 《中华人民共和国民法典》也提供了相应的保护，村民可以依据该法典中关于物权保护的规定，要求侵权人承担民事责任。

2. 诉讼时效问题：

   • 虽然从1998年至2025年时间跨度较长，但根据《中华人民共和国民法典》关于诉讼时效的规定，如果自权利受到损害之日起未超过二十年的，人民法院仍然会保护。因此，在此情况下，村民的起诉并未超过法定的诉讼时效期间。

3. 维权途径：

   • 村民可以先尝试与村民小组长进行协商解决，要求其停止侵占并返还土地。
   • 如果协商无果，村民可以向村民委员会或乡（镇）人民政府申请调解。
   • 若调解仍无法解决问题，村民可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

4. 法律后果：

   • 如果村民小组长的侵占行为被法院认定，其将承担相应的民事责任，包括停止侵害、返还土地、赔偿损失等。
   • 在某些情况下，如果侵占行为构成犯罪，村民小组长还可能面临刑事责任。

综上所述，村民小组长侵占集体土地的行为是违法的，村民有权起诉要求其停止侵害并返还土地。在起诉之前，村民可以尝试通过协商和调解的方式解决问题；如果无法解决，则可以通过法律途径维护自己的合法权益。如果您需要进一步的法律帮助或咨询，请随时向我提问。