建设单位超额支付进度款并无具体法律规定，但应遵循合同约定及行业惯例进行处理。具体分析如下：

一. 合同约定优先

• 发承包双方应在建设工程施工合同中明确工程进度款的支付时间、支付比例等具体条款。只要这些约定不违反法律法规的强制性规定，就应当严格按照合同约定执行。若合同中未对超额支付进度款作出规定，则应遵循行业惯例和公平原则进行处理。

二. 行业惯例与公平原则

• 在实际操作中，若建设单位超额支付了进度款，通常会首先与承包单位进行沟通，明确超额支付的原因和金额。
• 双方可根据实际情况协商处理方案，如将超额支付的部分作为后续工程进度款的预付款，或者由承包单位在后续工程款项中予以扣除并返还给建设单位。
• 若双方无法达成一致，可依据《中华人民共和国合同法》的相关规定，遵循公平原则，根据合同的性质、目的和交易习惯等因素，确定双方的权利和义务。

三. 特殊情况处理

• 若超额支付是由于建设单位的错误或疏忽导致的，且给承包单位造成了损失，承包单位有权要求建设单位承担相应的赔偿责任。
• 若超额支付是由于承包单位提供的信息不准确或误导导致的，承包单位应承担相应的责任，并与建设单位协商解决超额支付的问题。

我建议：在实际操作中，双方应严格按照合同约定执行工程进度款的支付事宜，并保持沟通顺畅。若出现超额支付的情况，应及时沟通并协商解决，以避免不必要的纠纷和损失。同时，双方也可在合同中明确约定超额支付的处理方式，以更好地保障双方的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。