“旷工一天扣三天工资”的做法，在大多数情况下是不合法的。因为它违反了《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规对于工资支付和扣除的规定。下面我将从几个方面详细解释这个问题，并提供相应的法律建议。

一、法律规定与解读

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这表明，用人单位无权随意扣除劳动者的工资。

2. 《工资支付暂行规定》第十六条进一步规定，若劳动者因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除的工资不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。这限制了用人单位扣除工资的比例和底线。

二、法理分析

从公平合理原则出发，旷工一天仅表示劳动者未提供这一天的劳动，用人单位有权不支付这一天的工资作为惩罚。但扣除三天工资则让劳动者承担了超出其过错程度的责任，这显然不公平，也违背了权利义务对等的基本法理原则。

三、特殊情况考量

若用人单位能证明劳动者旷工行为造成了额外三天工资数额的经济损失，并有确凿证据和合理计算依据，那么要求劳动者赔偿相应损失可能得到法律支持。但这与直接扣除工资是不同的法律概念，需通过合法途径处理。

四、合同条款与合法性

即使“旷工一天扣三天工资”作为劳动合同条款在员工入职时已明确告知，并得到了员工的同意，也不意味着该条款就合法。它必须不违反国家强制性法律法规，否则仍不具备法律效力。

五、实际操作建议

1. 协商解决：劳动者遇到此类情况，首先应与用人单位协商解决，表达自身合法权益。

2. 法律途径维权：协商不成时，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。具体维权途径包括：

   • 向当地劳动保障部门或工会举报，这些机构会依法进行调查，并采取相应的措施来保护劳动者的合法权益。
   • 若举报无果，劳动者可以依法申请调解、仲裁或提起诉讼。根据《中华人民共和国劳动法》第七十七条的规定，劳动争议可以通过调解、仲裁、诉讼等方式解决。

3. 保留证据：在维权过程中，劳动者应保留好相关证据，如工资条、劳动合同、出勤记录等，以便在需要时提供证明。

综上所述，“旷工一天扣三天工资”的做法在大多数情况下是不合法的。劳动者应了解自己的权益，必要时采取法律手段维护自身利益。如果你遇到此类问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为你提供专业的法律帮助。