投标文件被否决主要基于资格性审查不通过、符合性审查不通过以及存在违法违规行为。以下是对这些情形的详细解释：
一、资格性审查不通过
投标人资格不符合要求：如果投标人未提交相关资格证明文件，如营业执照、资质证书等，或者其资质等级、经营范围、业绩等不满足招标文件规定的资格条件，投标文件将被否决。
存在关联关系：不同投标人之间存在关联关系，如母子公司、控股关系等，可能影响招标公正性，也会导致投标文件被否决。
二、符合性审查不通过
投标文件未按要求签署、盖章：投标文件未经投标单位盖章和单位负责人签字，或者投标联合体没有提交共同投标协议，将被视为无效投标。
投标文件格式不符合要求：投标文件的排版、装订、份数等不符合招标文件的要求，或者投标文件格式混乱、内容相互矛盾，且无法澄清或说明，也将导致投标文件被否决。
投标报价问题：投标报价高于最高投标限价或低于成本价，或者同一投标人提交两个以上不同的投标文件或报价（除非招标文件明确要求提交备选投标），都将被视为不符合招标文件的要求，从而导致投标文件被否决。
投标有效期不符合要求：投标人承诺的投标有效期短于招标文件规定的期限，也将影响投标的有效性。
未响应招标文件的实质性要求和条件：投标文件未对招标文件的实质性要求和条件作出响应，如技术方案、质量承诺、交货期等不满足要求，同样会导致投标文件被否决。
三、存在违法违规行为
弄虚作假：投标人提供虚假业绩证明、财务报表、人员资质证书等材料，或编造虚假内容骗取中标，将被视为严重违法行为，投标文件将被否决。
串通投标：投标人之间相互勾结，或通过协商报价、轮流中标等方式操纵投标结果，或与招标人、招标代理机构串通影响评标结果，也将被视为严重违法行为，并导致投标文件被否决。
行贿等违法犯罪行为：投标人向招标人、评标委员会成员或其他相关人员行贿以谋取中标，同样会被视为严重违法行为，并导致投标文件被否决。
综上所述，投标人在准备投标文件时，应严格按照招标文件的要求进行编制，并确保文件的真实性、合法性和完整性。同时，投标人还应遵守相关法律法规和道德规范，避免任何违法行为，以维护投标过程的公平、公正和透明。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。