工程罚款因考勤问题并没有明确的法定上限。具体分析如下：

一. 考勤问题引发的工程罚款性质

• 考勤问题通常属于施工单位内部管理范畴，与工程合同的履行直接相关性不强。但当考勤问题影响到工程进度、质量或造成其他合同违约情形时，甲方可能会依据合同条款对施工单位进行罚款。
• 这种罚款在实质上更接近于违约金或损失赔偿，旨在弥补因施工单位违约行为给甲方造成的损失。

二. 罚款上限的法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第五百八十五条规定了违约金的约定及调整原则，即当事人可以约定违约金，但约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
• 然而，该条款并未直接规定工程罚款（特别是因考勤问题引发的）的具体上限。罚款的具体数额和上限通常由合同双方根据工程实际情况、违约行为的严重程度及可能造成的损失等因素在合同中约定。

三. 实际操作中的考虑

• 在实际操作中，甲方对施工单位的罚款应基于公平、合理及合同约定的原则进行。罚款数额应与实际损失或违约行为的严重程度相匹配，避免过高或过低的罚款导致双方权益失衡。
• 如施工单位认为罚款数额不合理或过高，可依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式维护自身权益。

我的观点：工程罚款因考勤问题并没有明确的法定上限，具体数额应由合同双方根据工程实际情况及违约行为的严重程度在合同中约定。如发生争议，可依据相关法律法规及合同约定通过相应途径解决。如有进一步需要，您可以继续咨询我。