毕业生不签就业协议书的后果，主要取决于个人的具体情况和未来的职业规划。一般来说，不签就业协议书可能会有以下几方面的影响：
影响报到证和档案派遣：对于部分高校，就业协议书是办理报到证和档案派遣的重要依据。如果不签就业协议书，可能会影响这些手续的办理，进而影响到毕业生的户口、档案等关系的迁移。不过，现在很多地区已经取消了报到证，档案也可以根据个人情况选择存放在户籍地人才市场或其他合适的地方，因此这一影响逐渐减弱。
可能影响学校统计就业率：就业协议书是高校统计毕业生就业情况的重要依据。不签就业协议书，可能会影响学校对就业率的统计，但这对毕业生个人来说，通常没有直接的实质性影响。
不影响劳动合同签订和权益保护：就业协议书并不等同于劳动合同，不签就业协议书并不影响毕业生与用人单位签订正式的劳动合同。毕业生的劳动权益主要受到《劳动法》和《劳动合同法》的保护，与是否签订就业协议书无关。只要与用人单位建立了劳动关系，无论是否签订就业协议书，毕业生都享有相应的劳动权益。
可能影响某些特定福利或政策：在某些地区或行业，对于签订了就业协议书的毕业生，可能会有一些特定的福利或政策倾斜，如住房补贴、人才引进政策等。不签就业协议书，可能会错过这些机会。但具体是否有影响，还需要根据当地或行业的具体政策来确定。
综上所述，毕业生不签就业协议书的影响是多方面的，但通常不会影响到毕业生的基本劳动权益。建议毕业生根据自己的具体情况和职业规划，权衡利弊后做出决定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。