虚开专票发票税额3万元，不一定会立案。具体分析如下：

1. 立案标准分析：

   • 根据最高人民检察院、公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》的相关规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，如果虚开的税款数额在十万元以上，或者造成国家税款损失数额在五万元以上，应予立案追诉。
   • 在此案例中，虚开的税款数额为3万元，未达到十万元的立案标准，同时也没有提及造成国家税款损失数额在五万元以上。

2. 其他严重情节考虑：

   • 虽然税额未达到立案标准，但如果存在其他严重情节，如多次虚开、手段恶劣、影响广泛等，也可能被立案追诉。然而，在此问题中并未提及存在其他严重情节。

3. 结论：

   • 因此，基于当前提供的信息，虚开专票发票税额3万元，不一定会立案。但需要注意的是，如果税务机关在检查过程中发现其他违法行为或严重情节，或者虚开行为导致国家税款损失超过五万元，仍有可能被立案追诉。

我建议：企业和个人应严格遵守税收法规，避免涉及虚开增值税专用发票等违法行为，以免面临严重的法律后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。