特区的基本法由全国人民代表大会制定。这一结论基于以下法律依据和事实分析：
一. 法律依据
《中华人民共和国宪法》的相关规定：
- 全国人民代表大会是最高国家权力机关，具有制定和修改宪法、法律等重要职权。特别行政区基本法作为一部涉及特别行政区政治、经济、文化等多方面的重要法律，其制定权自然归属于全国人民代表大会。
特别行政区基本法的性质：
- 特别行政区基本法在特别行政区内具有最高的法律地位，是特别行政区政治、经济、文化等各方面的基本规范。这一性质决定了其制定必须由国家最高权力机关来完成。
二. 制定过程
严谨而复杂的过程：
- 全国人民代表大会在制定特别行政区基本法时，会广泛征求各方意见，确保法律的合理性和可行性。制定完成后，还需经过严格的审议和表决程序，确保其具有法律效力和权威性。
具体制定实例：
- 以香港特别行政区基本法为例，其制定过程中成立了基本法立法委员会，设立立法小组，并邀请香港地区的知名人士参加，充分体现了制定过程的严谨性和民主性。
三. 法律地位与效力
最高法律地位：
- 特别行政区基本法在特别行政区内具有最高的法律地位，任何与基本法相抵触的法律、法规都无效。这一地位确保了特别行政区基本法的严肃性和稳定性。
对特别行政区法律的约束力：
- 特别行政区虽然享有高度自治权，包括立法权，但其制定的法律、法规不能同全国人大制定的本特别行政区的基本法相抵触。这体现了国家对特别行政区的基本法律框架的掌控和保障。
综上所述，特区的基本法由全国人民代表大会制定，这是基于《中华人民共和国宪法》的相关规定和特别行政区基本法的性质、制定过程以及法律地位与效力所确定的。这一结论体现了国家对特别行政区的基本法律框架的掌控和保障，也确保了特别行政区基本法的严肃性和稳定性。