合伙投资公司后期离职需遵循合伙协议及《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定进行处理。具体处理办法如下：

一. 查阅合伙协议

首先，应当查阅合伙协议中是否有关于合伙人离职的相关条款。这些条款可能包括离职后的股权处理、财产结算、竞业限制、违约责任等内容。

1. 股权处理：合伙协议中可能明确规定了离职时股权的退还方式、条件及时间。如果协议中有明确规定，应当按照协议执行。

2. 财产结算：离职时，其他合伙人应当按照退伙时的合伙企业财产状况与离职合伙人进行结算，退还其应得的财产份额。

3. 竞业限制：合伙协议中可能包含竞业限制条款，限制离职合伙人在一定期限内不得从事与合伙企业相竞争的业务。离职合伙人需遵守这些条款，否则可能面临违约责任。

4. 违约责任：合伙协议中还可能规定了离职合伙人的违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。

二. 遵循《中华人民共和国合伙企业法》

如果合伙协议中没有关于离职的具体约定，或者约定不明确，那么需要遵循《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定。

1. 退伙条件及程序：

   • 合伙协议约定合伙期限的，在合伙企业存续期间，有限合伙人可以基于以下情形退伙：合伙协议约定的退伙事由出现；经全体合伙人一致同意；发生合伙人难以继续参加合伙的事由；其他合伙人严重违反合伙协议约定的义务。
   • 合伙协议未约定合伙期限的，有限合伙人在不给合伙企业事务执行造成不利影响的情况下，可以退伙，但应提前三十日通知其他合伙人。

2. 退伙结算：退伙时，其他合伙人应当与退伙人按照退伙时的合伙企业财产状况进行结算，退还退伙人的财产份额。若退伙人对给合伙企业造成的损失负有赔偿责任，应相应扣减其应得份额。

3. 法律责任：退伙人对基于其退伙前的原因发生的合伙企业债务，承担无限连带责任。即使退伙后，对于退伙前的原因发生的合伙企业债务，退伙人仍需承担责任。

三. 处理建议

1. 仔细阅读合伙协议：在离职前，仔细阅读合伙协议中关于离职的相关条款，了解自己的权利和义务。

2. 与合伙人协商：如有必要，与合伙人进行沟通协商，就离职后的股权处理、财产结算等事宜达成一致意见。

3. 遵守法律法规：在离职过程中，严格遵守《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，避免违法行为导致的法律责任。

4. 咨询专业律师：如遇到复杂或争议较大的问题，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。

综上所述，合伙投资公司后期离职需遵循合伙协议及《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定进行处理。离职前应仔细阅读合伙协议，了解自己的权利和义务，并与合伙人进行充分沟通协商。如有必要，可咨询专业律师以确保合法合规。