股份代持协议到期后，公司应主动变更股东登记。具体分析如下：

一. 股份代持协议的法律效力

1. 股份代持协议是双方真实意思的表示，不违反法律法规的强制性规定，合法有效。协议到期后，双方的权利义务关系终止，应按照协议约定或相关法律规定处理后续事宜。

二. 股东登记的变更义务

1. 《中华人民共和国公司法》第三十二条规定：“记载于股东名册的股东，可以依股东名册主张行使股东权利。公司应当将股东的姓名或者名称向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。”由此可知，公司负有办理股东登记或变更登记的义务。
2. 股份代持协议到期后，实际出资人与名义股东之间的代持关系终止，公司应根据实际出资人的要求或协议约定，主动办理股东变更登记，以确保公司登记信息的真实性和准确性。

三. 变更登记的法律后果

1. 公司主动变更股东登记后，实际出资人将正式成为公司股东，享有股东权利并承担股东义务。
2. 如公司未主动变更股东登记，可能面临实际出资人提起的诉讼，要求公司履行变更登记义务，并可能承担因此产生的法律责任。

综上所述，股份代持协议到期后，公司应主动变更股东登记，以确保公司登记信息的真实性和准确性，并维护实际出资人的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。