标准工时制、不定时工时制和综合工时制的主要区别在于其工作时间安排、适用对象及加班费计算方式。

一. 标准工时制

1. 工作时间安排：根据《劳动法》和《国务院关于职工工作时间的规定》，标准工时制要求职工每日工作不超过8小时，每周工作不超过40小时。这是最基本且普遍适用的工时制度。
2. 适用对象：原则上，所有企业都应实行标准工时制，除非因特殊生产需求或工作性质无法适用。
3. 加班费计算：若企业安排职工在标准工作时间外加班，需按照《劳动法》第四十四条的规定支付加班费。

二. 不定时工时制

1. 工作时间安排：不定时工时制没有固定的工作时间限制，适用于因工作性质特殊、无法按标准工作时间衡量的职工。
2. 适用对象：根据《劳动部关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》第四条，企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员等，以及因工作性质特殊需机动作业的职工，可以实行不定时工作制。
3. 加班费计算：实行不定时工作制的职工，除法定节假日工作外，其他时间工作不算加班，因此不享受加班费。

三. 综合工时制

1. 工作时间安排：综合工时制是以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间的工作制度。但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
2. 适用对象：根据《劳动部关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》第五条，交通、铁路、邮电等行业中因工作性质特殊需连续作业的职工，以及受季节和自然条件限制的行业职工等，可以实行综合工时制。
3. 加班费计算：在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。超过部分应视为延长工作时间，并按《劳动法》第四十四条的规定支付加班费。

我建议，企业在选择工时制度时，应充分考虑自身的生产特点、工作性质及职工需求，确保既符合法律法规要求，又能有效保障职工的合法权益。同时，对于实行不定时工作制和综合工时制的职工，企业应采取适当的休息方式，确保职工的休息休假权利和生产、工作任务的完成。如有进一步需要，您可以继续咨询我。