亲子鉴定不能直接鉴别父亲和爷爷的关系。以下是详细分析：

一. 亲子鉴定的原理与目的

1. 原理：亲子鉴定是通过比对分析DNA序列中的特定遗传标记，来确定两个或多个个体之间是否存在亲生血缘关系。
2. 目的：通常用于确认父母与子女之间的亲缘关系，如父子、母子等。

二. 为何不能直接鉴别父亲和爷爷的关系

1. 遗传信息的传递：在遗传学中，子女的DNA来自父母，而父母的DNA又来自他们的父母。因此，孙辈的DNA中确实包含祖辈的遗传信息，但这种信息是间接的，且经过了一代的遗传重组。
2. 复杂性：直接通过孙辈的DNA来鉴别其父亲与爷爷的关系，技术上极为复杂，且准确性难以保证。因为孙辈的DNA中既包含父亲的遗传信息，也包含母亲的遗传信息，且这些信息在遗传给孙辈时可能发生了重组和变异。
3. 法律与伦理考量：在大多数情况下，进行此类鉴定可能涉及复杂的法律与伦理问题，如隐私权、家庭关系等。

三. 正确的做法

1. 确认父子关系：如需确认某人与其父亲的关系，最直接且准确的方法是进行父子之间的亲子鉴定。
2. 结合其他证据：在某些特殊情况下，如父亲已去世或无法直接进行亲子鉴定，可能需要结合其他证据（如家族谱系、历史记录等）来综合判断。

我的观点：亲子鉴定是确认亲生血缘关系的重要手段，但其应用应严格遵循科学原理和法律法规。对于父亲与爷爷之间的亲缘关系，不能直接通过亲子鉴定来确认，而应寻求其他合适的途径或方法。如有进一步需要，您可以继续咨询我。