违法装车顶行李架发生交通事故，保险公司可能会拒赔。下面我将对此进行详细分析：

一. 违法装车顶行李架的影响

1. 违反交通法规：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，车辆加装或改装需符合相关规定，未经批准擅自加装车顶行李架属于违法行为。
2. 增加风险：违法装车顶行李架可能会改变车辆的重心，影响车辆的稳定性和安全性，从而增加发生交通事故的风险。

二. 保险公司拒赔的依据

1. 保险合同约定：保险合同中通常会约定，被保险人应遵守国家有关法律法规，如果因违法行为导致交通事故，保险公司有权拒赔。
2. 风险增加未通知：根据《保险法》第五十二条，如果保险标的的危险程度显著增加，被保险人应当及时通知保险人。违法装车顶行李架显然增加了车辆的风险，如果未通知保险公司，保险公司有权拒赔。

三. 实际案例

• 例如，某车主擅自加装车顶行李架后发生交通事故，向保险公司申请理赔。保险公司调查发现该加装行为违法，且未事先通知保险公司，最终拒赔了车主的索赔申请。

综上所述，违法装车顶行李架发生交通事故，由于违反了交通法规并增加了车辆的风险，保险公司很可能会根据保险合同的约定拒赔。因此，我建议车主在加装或改装车辆前，应先了解相关法律法规，并咨询保险公司的意见，以免因违法行为导致保险失效。如有进一步需要，您可以继续咨询我。