运输非法出版物，依据《出版物市场管理规定》第三十九条，将按照第三十三条进行处罚，即没收出版物和非法所得，情节严重的还可能面临罚款、限期停业整顿或吊销许可证等处罚。具体分析如下：

1. 法规依据：

   • 根据《出版物市场管理规定》第二十二条，明确列出了不得发行的出版物类型，包括非法出版物等。
   • 第三十三条则规定了发行这些非法出版物的处罚措施，包括没收出版物、违法所得，以及可能的罚款、限期停业整顿或吊销许可证等。
   • 第三十九条进一步规定，征订、储存、运输、邮寄、投递、散发、附送这些非法出版物的，也按照第三十三条进行处罚。

2. 处罚措施：

   • 对于运输非法出版物的行为，首先会面临出版物和非法所得的没收。
   • 如果情节严重，还可能被处以罚款，甚至限期停业整顿或吊销相关许可证。

3. 实际案例：

   • 以山东济宁嘉祥县和威海的案例为例，物流公司因储存、运输非法出版物被查处，并受到了没收非法出版物和罚款的行政处罚。

我建议：对于涉及出版物的运输，应严格审查所运货物的合法性，避免运输非法出版物，以免触犯法律并遭受相应的处罚。如有进一步需要，您可以继续咨询我。