配合事项清单的法律责任主要由县级职能部门承担，乡镇人民政府承担配合责任。具体分析如下：

一. 责任主体明确

根据霍邱县人民政府关于公布霍邱县乡镇审批事项清单、行政执法事项清单和配合事项清单的通知，配合事项清单的责任主体是县级职能部门，乡镇人民政府则承担配合责任。这意味着，在配合事项的执行过程中，如果出现问题或违法行为，县级职能部门将承担主要的法律责任。

二. 具体责任划分

1. 县级职能部门：作为配合事项清单的责任主体，县级职能部门需要负责配合事项的具体执行、监督和管理。如果因县级职能部门未履行或未正确履行其职责导致的问题或违法行为，县级职能部门将承担相应的法律责任。

2. 乡镇人民政府：虽然乡镇人民政府在配合事项中承担配合责任，但也需要积极参与并配合县级职能部门的工作。如果乡镇人民政府未按照要求履行配合职责，也可能因此承担相应的法律责任，但通常这种责任是次要的或辅助性的。

三. 法律责任的形式

法律责任的形式可能包括但不限于行政责任、民事责任甚至刑事责任，具体取决于违法行为的性质、情节和后果。对于配合事项清单中的违法行为，相关部门将依法进行调查处理，并根据实际情况追究相关责任人的法律责任。

我建议在实际操作中，县级职能部门和乡镇人民政府应明确各自的职责和义务，加强沟通协作，确保配合事项清单的顺利执行。同时，也应加强对相关人员的培训和指导，提高其法律意识和执行能力，以有效防范和降低法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。