美团扣款商家违约金是否合法，需根据具体情况判断，主要看合同约定以及扣款行为是否符合相关法律规定。以下是对此问题的详细分析：

一. 合同约定是判断基础

1. 合同法的应用：根据《合同法》的相关规定，当事人双方可以约定违约金作为违约责任的承担方式。因此，如果美团与商家在合同中明确约定了违约金条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么美团依据合同条款扣款商家违约金是合法的。

• 例如，合同中明确约定，若商家违反某项规定，美团有权扣除一定金额的违约金，这样的扣款行为就是基于合同约定的，因此是合法的。

二. 扣款行为需符合法律规定

1. 不得滥用权利：虽然合同中有违约金条款，但美团在扣款时仍需遵守相关法律法规，不得滥用权利。如果美团扣款金额过高，或者扣款行为缺乏合理依据，可能构成对商家权益的侵害。
2. 公平原则：根据《合同法》的公平原则，当事人在履行合同过程中应当遵循公平原则确定各方的权利和义务。因此，美团扣款商家违约金的金额应当合理，不能显失公平。

• 例如，如果美团因商家轻微违约就扣除高额违约金，这显然违反了公平原则，商家有权要求调整违约金金额。

三. 商家的救济途径

1. 协商：商家可以与美团进行协商，就违约金的问题达成一致意见。
2. 诉讼或仲裁：如果协商无果，商家可以依据合同中的争议解决条款，通过诉讼或仲裁的方式维护自己的合法权益。

我建议商家在面临美团扣款违约金的情况时，首先检查合同条款，了解违约金的约定情况。如果认为扣款行为不合法或显失公平，可以积极与美团沟通协商，或者通过法律途径维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。