安全员未到岗，处罚的是个人。具体分析如下：

一. 安全员未到岗的法律责任

1. 具体规定：根据《建筑施工企业主要负责人、项目负责人和专职安全生产管理人员安全生产管理规定》第三十三条，专职安全生产管理人员未按规定履行安全生产管理职责的，由县级以上地方人民政府住房城乡建设主管部门责令限期改正，并处1000元以上5000元以下的罚款。
2. 实际应用：在此案例中，苍南县住房和城乡建设局对未在岗的安全员个人进行了2000元的罚款处罚，正是因为其未履行安全生产管理职责。

二. 处罚对象的分析

1. 针对个人：处罚是针对未在岗的安全员个人，而非公司。这是因为安全员作为个人，有义务按照规定履行安全生产管理职责。若其未能履行该职责，则应承担相应的法律责任。
2. 公司责任另论：虽然公司可能对安全员的管理和监督负有一定责任，但在此类处罚中，主要责任还是由未履行职责的安全员个人承担。当然，如果公司存在对安全员管理不善或未提供必要支持等问题，也可能面临相应的法律后果，但这与安全员个人的处罚是分开的。

我建议：在建筑工程领域，安全无小事。安全员作为施工现场的重要角色，应严格遵守相关规定，每天到岗并认真履行安全生产管理职责。同时，公司也应加强对安全员的管理和支持，共同确保施工安全进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。