正在上诉阶段专利被国知局宣告无效，法院会裁定驳回起诉。具体分析如下：

一. 专利无效宣告对侵权诉讼的影响

• 专利被国知局宣告无效后，该专利视为自始即不存在。因此，基于该专利提起的侵权诉讼失去了权利基础。
• 在侵权诉讼的上诉阶段，如果专利被宣告无效，法院将不再继续审理该侵权案件。

二. 法院的具体处理方式

1. 裁定驳回起诉：根据专利无效的情况，法院会裁定驳回原告的起诉。这意味着，原告基于该专利提起的侵权诉讼将被终止，法院不再对案件进行实体审理。
2. 上诉费退还：被告方预交的上诉费会全部退还，因为案件已经没有必要继续审理。

三. 后续可能的情况

• 行政诉讼：专利权人对国知局的无效决定不服的，可以提起行政诉讼。此时，被告为国家知识产权局，无效请求人为第三人。
• 重新起诉：如果在行政诉讼中，宣告专利无效的决定被法院撤销，则专利权人可以另行起诉，即一切回到原点，重新进行侵权诉讼。

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