针对你提出的“大学毕业签三方协议公司要求赔偿违约金三千五，起诉怎么办”的问题，我首先明确一点：如果公司违约且要求你赔偿违约金，你可以通过法律途径来维护自己的权益。接下来，我将详细解释你可以采取的步骤：

1. 查看三方协议：

   • 仔细审查三方协议中关于违约责任的具体条款，特别是是否有明确提及违约金的数额和支付条件。
   • 确认自己是否确实存在违约行为，以及该行为是否构成协议中规定的违约情形。

2. 与公司协商：

   • 在确认自己无违约或违约行为有争议的情况下，尝试与公司进行沟通，解释你的情况，并寻求和解或重新协商协议条款。
   • 如果公司坚持要求赔偿违约金，你可以提出反驳意见，并指出协议中可能存在的不公平或不合理之处。

3. 寻求法律援助或咨询：

   • 如果协商无果，你可以考虑咨询专业律师（比如我这样的专业律师哦，专注于婚姻家庭、合同纠纷领域），获取更具体的法律建议。
   • 律师可以帮助你评估案件的胜诉可能性，提供法律策略，并代表你与公司进行谈判或提起诉讼。

4. 准备证据：

   • 收集所有与三方协议相关的证据，包括协议文本、沟通记录、邮件往来等。
   • 这些证据将在后续的法律程序中起到关键作用，帮助你证明自己的立场和主张。

5. 提起诉讼：

   • 如果公司仍然坚持要求赔偿违约金，并且你认为自己的权益受到了侵害，你可以依据《民法典》的相关规定，向有管辖权的法院提起诉讼。
   • 在诉讼过程中，你需要提交详细的起诉状和证据材料，并遵循法院的诉讼程序。

6. 法律后果：

   • 如果法院认定公司存在违约行为或协议条款不公平，可能会判决公司承担违约责任，包括赔偿你因此遭受的损失。
   • 如果法院认定你存在违约行为，并且协议中的违约金条款合法有效，你可能需要支付相应的违约金。

在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。同时，也要记住保留好所有相关证据，以便在需要时能够证明自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。