事业单位法人登记的开办资金可以保留小数点后六位。以下是对此问题的详细分析：
一. 开办资金的定义与范畴
定义：根据《事业单位登记管理暂行条例》及其实施细则，事业单位开办资金是事业单位被核准登记时可用于承担民事责任的全部财产的货币体现。它必须符合三个条件：一是必须是举办单位授予的可以自主处置的财产或者事业单位法人的自有财产；二是登记时事业单位法人的全部财产；三是以人民币表示。
范畴：开办资金包括事业单位法人的固定资金、流动资金，用于事业发展的专用资金，已经转化为货币形式的专用技术、专利技术、商标等产权。但不包括代为管理的公共基础设施和资源性资产、关系国家秘密、公共安全、公共保障不能进入流通领域的资产、借贷款、合同预收款、合同应付款、职工福利费、保险金、住房公积金等专用基金，以及规定了使用方向不能用于民事赔偿的他人资助的资产等。
二. 开办资金的数额表示
单位与精度：事业单位法人登记的开办资金以万元为单位，且按照相关规定，最多可以保留小数点后六位。这意味着，无论开办资金的实际数额是多少，其在登记时都将以万元为单位，并精确到小数点后六位。
实例说明：例如，某事业单位的开办资金为1234567.89元，那么在法人登记时，其开办资金将表示为123.456789万元。
三. 开办资金的变更与登记
变更情形：开办资金是动态变化的，当开办资金比原登记的开办资金数额增加或者减少超过20%时，事业单位应当申请变更登记。
变更程序：申请变更开办资金的事业单位需登录相关登记管理系统，填写变更登记申请表，并上传变更登记申请日之前90日内的资产负债表等证明材料。变更申请通过后，事业单位需递交申请材料的纸质版及原事业单位法人证书正、副本原件以换领新证书。
综上所述，事业单位法人登记的开办资金可以保留小数点后六位。这一规定既确保了开办资金数额的精确性，又便于事业单位进行法人登记和变更登记。如有进一步需要，您可以继续咨询我。