非法批地批准文件无效的认定机关为县级以上人民政府土地行政主管部门。以下是对此问题的详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法律法规，土地的使用和批准需严格遵守法律规定。非法批地，即未经合法程序或超越权限批准使用土地的行为，是违法的，其批准文件自然无效。

认定机关

1. 县级以上人民政府土地行政主管部门：根据法律规定，县级以上人民政府土地行政主管部门负责土地的管理和监督工作，包括土地的批准、使用、转让等。因此，对于非法批地的行为，县级以上人民政府土地行政主管部门有权进行认定，并宣布其批准文件无效。

2. 具体流程：通常，土地行政主管部门在发现非法批地行为后，会进行调查取证，确认事实。一旦确认存在非法批地行为，行政主管部门会依法作出处理决定，宣布批准文件无效，并可能对相关责任人进行处罚。

法律建议

1. 合规使用土地：建议所有土地使用者在申请使用土地时，务必遵守法律规定，通过合法程序获得批准。

2. 咨询与举报：对于发现的非法批地行为，可以向县级以上人民政府土地行政主管部门进行举报，以维护土地管理的秩序和合法权益。

3. 法律救济：如果因非法批地行为导致权益受损，可以依法向有关部门申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，非法批地批准文件无效的认定机关为县级以上人民政府土地行政主管部门。在使用土地时，务必遵守法律规定，确保土地的合法使用。