商务办公楼在一定条件下可以限制自然人购买。具体来说：

1. 新建商业、办公类项目的限制：

   • 自2017年3月26日起，新建的商业、办公类项目不允许出售给居民个人。这意味着，在此日期之后新建的商务办公楼，自然人是无法购买的。

2. 已销售商业、办公类房屋的再出售限制：

   • 对于2017年3月26日前已销售的商业、办公类房屋，再次出售时，购买人须满足一定条件，包括名下无住房及其它商业、办公类房屋，且近5年在京连续缴纳社会保险或个人所得税。这一规定适用于京籍和非京籍居民，审核标准相同。

3. 特殊区域的限制：

   • 值得注意的是，对于北京通州区的商业、办公类房屋，自2016年5月5日开始的新建项目，只能出售给企事业单位或社会组织，个人无法购买。

综上所述，商务办公楼在是否限制自然人购买方面，受到政策、时间、区域等多重因素的影响。因此，在购买前，建议详细了解相关政策规定，并咨询当地房地产交易部门或专业律师，以确保交易的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。