在违法分包后，如果施工总承包单位拖欠工程款不付款，分包单位可以采取法律手段来维护自身权益。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析和应对：

一. 确认违法分包事实

• 首先，需要明确是否存在违法分包的事实。根据相关法律法规，违法分包通常指的是总承包单位将工程分包给不具备相应资质的单位或个人，或者分包单位再次将工程分包等违法行为。
• 如果确实存在违法分包，那么分包合同可能无效，但这并不影响分包单位向总承包单位追讨工程款的权利。

二. 依据合同及法律规定追讨工程款

• 尽管分包合同可能因违法而无效，但分包单位实际完成了工程并投入了相应的人力、物力，因此有权要求总承包单位支付相应的工程款。
• 如果总承包单位拒绝支付，分包单位可以依据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院提起诉讼，要求总承包单位承担支付工程款的责任。

三. 注意诉讼时效

• 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。
• 因此，分包单位在追讨工程款时，应注意在诉讼时效期间内提起诉讼，以确保自己的权益得到法律保护。

四. 采取其他合法手段

• 除了诉讼外，分包单位还可以考虑与总承包单位进行协商、调解等方式来解决纠纷。
• 同时，也可以向相关行政部门投诉总承包单位的违法行为，要求其承担相应的法律责任。

我建议：分包单位在追讨工程款时，应首先确认违法分包的事实，并依据合同及法律规定采取相应的法律手段。同时，注意诉讼时效的规定，确保在法定期间内提起诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。