关于夫妻双方名下有两套经济适用房的合法来源说明，这主要涉及到房产的取得时间、出资情况以及夫妻间的约定等多个方面。以下是对这一问题的详细分析：

1. 房产取得时间：

   • 如果两套经济适用房都是在夫妻婚姻关系存续期间购买的，那么根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，这些房产通常应视为夫妻共同财产，除非夫妻间有特殊的书面约定。
   • 如果其中一套或两套房产是在婚前购买的，那么需要看具体的出资情况和夫妻间的约定来确定其归属。如果是由一方单独出资购买，并且登记在该方名下，那么通常视为该方的个人财产。但如果双方有共同出资或婚后共同还贷的情况，那么可能需要对房产的归属进行进一步的分割。

2. 出资情况：

   • 对于经济适用房的购买，出资情况是一个重要的考量因素。如果夫妻双方都有出资，即使房产证上只登记了一方的名字，也可能被视为夫妻共同财产。
   • 如果一方在婚前支付了房产的首付款，并在婚后与另一方共同还贷，那么对于婚后还贷部分及其对应的增值部分，另一方通常有权主张进行分割。

3. 夫妻间的约定：

   • 夫妻间可以通过书面协议来约定房产的归属。这种约定具有法律效力，可以优先于法律的一般规定。
   • 如果夫妻间有明确的约定，比如约定某套房产归一方所有，那么即使该房产是在婚姻关系存续期间购买的，也可能被视为该方的个人财产。

综上所述，夫妻双方名下两套经济适用房的合法来源说明，需要根据房产的取得时间、出资情况以及夫妻间的约定等多个方面来综合判断。如果在这方面存在疑问或争议，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。