工作合同违约金在特定情况下是合法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法的情况：

   • 服务期约定：根据《劳动合同法》的相关规定，如果用人单位为劳动者提供专项培训费用，并对其进行专业技术培训，可以与劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
   • 竞业限制约定：用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。竞业限制的人员限于用人单位的高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员，且竞业限制的期限不得超过二年。

2. 不合法的情况：

   • 除了上述两种情况外，如果劳动合同中约定劳动者承担违约金，如约定劳动者提前离职需要支付违约金等，这种约定通常是不合法的。因为《劳动合同法》明确规定了，除服务期和竞业限制两种情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。

综上所述，工作合同中违约金的合法性取决于其是否符合法律规定的特定情形。在签订劳动合同时，双方应谨慎约定违约金条款，确保其合法性和合理性，以维护双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。