若您的建设银行账户已设置自动还款功能且余额充足，系统会继续自动扣款以偿还剩余欠款。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 自动还款功能的运作机制

• 建设银行若为您的账户设置了自动还款功能，该功能会在还款日自动从您的账户中扣除应还款项。
• 若您已部分还款（如本题中的还款1万），但仍有欠款未还清（剩余1万），且您的账户余额充足，那么系统会在后续的还款日继续自动扣款以偿还剩余欠款。

二. 法律依据

• 根据《中华人民共和国民法典》第六百七十五条，借款人应当按照约定的期限返还借款。这意味着，您有义务按照约定的还款计划偿还建设银行欠款。
• 同时，若您与建设银行之间就还款方式（如自动还款）有明确约定，且该约定不违反法律法规，那么银行有权按照约定方式扣款。

三. 实际情况考量

• 账户余额是否充足：若您的账户余额不足以支付剩余欠款，银行可能无法成功扣款，此时您可能需要手动还款或面临逾期风险。
• 自动还款设置：若您未设置自动还款或已取消该功能，银行则不会自动扣款，您需要自行关注还款情况并按时还款。

综上所述，若您的建设银行账户已设置自动还款功能且余额充足，系统会继续自动扣款以偿还剩余欠款。我建议您检查自己的账户设置和余额情况，确保能够按时还清剩余欠款，避免逾期产生的额外费用和信用影响。如有进一步需要，您可以继续咨询我。