境外劳务派遣工资超过5000元的计算方式，主要需考虑个人所得税的缴纳，具体根据个人在境内的居住时间判定其居民身份，从而确定纳税义务。

一. 居民个人与非居民个人的判定

• 根据《中华人民共和国个人所得税法》第一条，若个人在中国境内有住所，或者无住所但一个纳税年度内在中国境内居住累计满一百八十三天，则被视为居民个人。居民个人需就其从中国境内和境外取得的所得缴纳个人所得税。
• 若个人在中国境内无住所且不居住，或者无住所但一个纳税年度内在中国境内居住累计不满一百八十三天，则被视为非居民个人。非居民个人仅需就其从中国境内取得的所得缴纳个人所得税。

二. 个人所得税的计算

• 对于居民个人，其境外劳务派遣工资需与境内所得合并，按纳税年度合并计算个人所得税。
• 对于非居民个人，其境外劳务派遣工资若超过5000元，则需按月或者按次分项计算个人所得税。
• 具体税额的计算还需考虑个人所得税的税率、速算扣除数以及可能的免税额或减税政策。

三. 实际操作建议

• 我建议，对于境外劳务派遣工资超过5000元的情况，首先确定个人的居民身份，然后依据相关税法规定计算应缴纳的个人所得税。
• 由于税法可能涉及复杂的计算规则和最新的政策调整，因此建议在实际操作中咨询专业的税务机构或税务顾问，以确保计算的准确性和合规性。

如有进一步需要，您可以继续咨询我。