针对您提出的“实刑三年两次怀孕会怎么样”的问题，以下是根据相关法律法规和常规处理流程给出的详细解答：
首先，我们需要明确的是，怀孕并不是免除刑罚的理由。然而，我国法律对怀孕的女性罪犯确实给予了特殊照顾，以确保其基本权利得到保障。
一、法律依据
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于被判处有期徒刑或者拘役的罪犯，如果怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女，可以暂予监外执行。这一规定同样适用于被判处实刑三年的情况。
二、处理流程
暂予监外执行的申请与审批：
- 当女性罪犯在服刑期间怀孕时，其本人或其家属可以向执行机关提出申请暂予监外执行。
- 执行机关将审核申请，并依据省级人民政府指定医院的诊断证明和评估报告作出决定。
- 如果申请被批准，罪犯将在社区或其他指定地点接受监管，而非在监狱服刑。
暂予监外执行期间的监管：
- 在此期间，罪犯需要严格遵守监管规定，如定期向执行机关报告活动情况，并接受监督检查。
- 执行机关会定期对罪犯的情况进行评估，以确保暂予监外执行的合法性和安全性。
暂予监外执行情形消失后的处理：
- 当怀孕或哺乳情形消失（如分娩后身体恢复正常，婴儿不再处于哺乳期），且罪犯身体状况允许时，执行机关将依法将其收监执行剩余的刑期。
- 如果罪犯在暂予监外执行期间表现良好，有悔改表现或立功表现，可能会经过严格的法定程序获得减刑等处理。
三、特殊情况处理
- 如果罪犯在实刑三年期间两次怀孕，每次怀孕都可能触发暂予监外执行的程序。但需要注意的是，每次暂予监外执行的申请和审批都是独立的，需要依据当时的法律规定和实际情况进行决定。
- 如果罪犯在暂予监外执行期间再次怀孕，且符合暂予监外执行的条件，那么她可能会继续享受暂予监外执行的待遇，直到怀孕或哺乳情形再次消失。
四、总结
总的来说，实刑三年两次怀孕的情况下，罪犯可能会根据法律规定和实际情况被暂予监外执行。但需要注意的是，这并不意味着罪犯可以完全逃避法律的制裁。一旦暂予监外执行的情形消失，罪犯仍需回到监狱完成剩余的刑期。同时，罪犯在暂予监外执行期间也需要严格遵守监管规定，确保自己的行为符合法律要求。