对于判实刑三年但是怀孕了的情况，我国法律有明确的规定来保障孕妇及胎儿的特殊权益，确保在处理此类案件时既体现法律的公正性，又兼顾人道主义关怀。具体处理方式如下：

1. 暂予监外执行：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百六十五条，对被判处有期徒刑或者拘役的罪犯，如果怀孕或者正在哺乳自己婴儿的妇女，可以暂予监外执行。这一规定确保了孕妇能够在适宜的环境中待产和哺乳，体现了对母婴健康的重视。
   • 申请与审批：符合条件的怀孕女性罪犯或其家属可向执行机关提出申请暂予监外执行。执行机关将审核申请，并依据省级人民政府指定医院的诊断证明和评估报告作出决定。若批准，罪犯将在社区或其他指定地点接受监管，而非在监狱服刑。
   • 监管与收监：在暂予监外执行期间，罪犯需严格遵守监管规定，如定期向执行机关报告活动情况，并接受监督检查。当怀孕或哺乳情形消失（如分娩后身体恢复正常，婴儿不再处于哺乳期），且罪犯身体状况允许时，执行机关将依法将其收监执行剩余的刑期。

2. 审判阶段的特殊处理（若案件尚未进入执行阶段）：

   • 取保候审与监视居住：在审判阶段，如果怀孕的妇女采取取保候审不致发生社会危险性，司法机关可以决定对其取保候审，允许其在外面等待审判结果，避免羁押在看守所。同样，对于符合逮捕条件但怀孕的妇女，可以适用监视居住，即在指定区域居住并接受行动监视，以降低限制程度。
   • 死刑的排除：虽然此情况与判实刑三年不直接相关，但值得注意的是，《中华人民共和国刑法》第四十九条明确规定，审判时怀孕的妇女不适用死刑，这体现了对怀孕妇女的特殊保护原则。

3. 法律原则与人道主义考虑：

   • 明确法律责任：怀孕并非免除刑事责任的合法理由，犯罪后仍需按法律程序接受相应刑罚。
   • 特殊考虑：法律对怀孕女性给予特殊考虑，旨在平衡刑罚的公正性与人道主义关怀，确保其合法权益及胎儿或婴儿的健康得到保障。
   • 综合判断：具体处理方式需根据案情、法律规定及相关政策综合判断。例如，如果罪犯在暂予监外执行期间表现良好，有悔改表现或立功表现，可能会经过严格的法定程序获得减刑等处理。

总结与建议：

对于判实刑三年但是怀孕了的情况，法律提供了全面的保护措施，包括暂予监外执行、审判阶段的取保候审和监视居住等。这些规定不仅体现了法律对怀孕妇女的特殊关怀，也确保了法律制裁的公正性和有效性。

在实际操作中，建议罪犯或其家属及时咨询并了解相关法律规定和程序，积极配合执行机关的工作，确保罪犯的合法权益得到妥善保护。同时，罪犯也应认识到自己的法律责任，遵守法律法规和监管要求，为未来的回归社会做好准备。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。