公司克扣提成工资，申请仲裁时可以要求支付利息，并且有法律依据。

首先，《劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”公司克扣提成工资，属于未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的情况，违反了上述法律规定。

其次，《劳动合同法》第八十五条规定：“用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：……（三）安排加班不支付加班费的；（四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。”虽然此条款未直接提及克扣工资需支付利息，但“加付赔偿金”的表述已体现了对用人单位违法行为的惩罚性，且赔偿金的计算方式（按应付金额的一定比例）与利息的计算方式（按本金及一定利率）在本质上具有相似性，均是对劳动者因用人单位违法行为所受损失的补偿。因此，在仲裁实践中，劳动者主张用人单位克扣工资需支付利息的，仲裁机构往往会结合案件具体情况，参照上述法律规定予以支持。

综上所述，公司克扣提成工资时，劳动者在申请仲裁时可以要求支付利息，并且这一要求有明确的法律依据。在申请仲裁时，劳动者应详细陈述公司克扣工资的事实，并提供相关证据，如工资条、劳动合同、银行流水等，以支持自己的主张。