工伤后在两个医院都做了同样检查，工伤认定时并不一定需要提交两份检查报告。具体分析如下：
在工伤认定的过程中，医疗检查报告是重要的参考材料之一，但它并不是唯一的决定因素。工伤认定的主要依据是工伤事故的发生情况、员工的伤情以及相关的法律法规。
提交一份即可：如果你在两个医院都做了同样的检查，并且结果相一致，那么提交其中一份检查报告给工伤认定部门就可以了。这份报告将作为你工伤认定的医疗证据之一。
特殊情况需说明：如果两份检查报告存在差异，或者工伤认定部门对某份报告有疑问，那么你可能需要提交两份报告，并附上相关的解释和说明。在这种情况下，两份报告可以相互印证，帮助工伤认定部门更全面地了解你的伤情和医疗情况。
关注工伤认定流程：除了医疗检查报告，工伤认定还需要考虑其他因素，如工伤事故的发生时间、地点、经过等。因此，在提交报告的同时，你也需要准备好其他相关的证明材料，如工伤事故报告、证人证言等。
总之，在工伤认定时，你只需提交一份准确、可靠的医疗检查报告即可。如果两份报告存在差异或特殊情况，你需要及时与工伤认定部门沟通，并提供必要的解释和说明。在整个过程中，确保你的伤情和医疗情况得到真实、全面的反映，以便工伤认定部门能够做出准确的认定。