关于“留置期间被调查人有与对方微信转账3000元的记录，纪委会认定关联人吗”的问题，以下是我的分析：
首先，我们需要明确几个关键点：留置期间、微信转账记录、以及纪委的认定标准。
留置期间：通常指的是被调查人被纪检监察机关采取的一种强制措施，用于调查其涉嫌的违纪或违法行为。在此期间，被调查人的所有行为都可能受到监督和审查。
微信转账记录：这是一种电子支付凭证，记录了转账的时间、金额、双方账户等信息。在纪检监察的调查中，这类记录往往被视为重要的证据之一。
纪委的认定标准：纪委在调查过程中，会根据收集到的证据材料，结合相关法律法规和党内规定，对被调查人的行为进行性质认定。关联人的认定通常基于证据材料所反映的事实，以及这些事实与被调查人行为之间的关联性。
接下来，我们分析这个问题：
转账记录的性质：微信转账3000元，这一行为本身并不直接决定被调查人是否构成违纪或违法，也不直接决定该转账对象是否为关联人。它只是一个客观存在的事实，需要与其他证据材料一起，由纪委进行综合分析和判断。
纪委的认定过程：纪委在调查过程中，会综合考虑多种因素，包括转账的时间、金额、频率、目的、双方的关系等，以及这些因素与被调查人涉嫌的违纪或违法行为之间的关联性。如果转账记录能够与其他证据材料相互印证，形成完整的证据链，那么纪委可能会认定该转账对象与案件有关联，从而将其认定为关联人。
可能的结果：因此，留置期间被调查人有与对方微信转账3000元的记录，并不一定会被纪委认定为关联人。这取决于转账记录本身的情况，以及它与其他证据材料之间的关联性和证明力。
综上所述，留置期间被调查人有与对方微信转账3000元的记录，并不能直接决定其是否会被纪委认定为关联人。这需要根据具体的案件情况和证据材料进行综合分析和判断。如果你有更具体的案情或证据材料，我可以为你提供更详细的法律分析和建议。