关于土地承包经营权和地役权的设立与登记问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、地役权的性质与设立
地役权是按照合同约定利用他人的不动产，以提高自己不动产效益的权利。它属于用益物权的一种，具有从属性、不可分性等特点。地役权自地役权合同生效时设立，这意味着地役权的产生并不以登记为必要条件，而是基于合同的有效成立。然而，为了增强地役权的法律效力和对抗性，当事人可以选择向登记机构申请地役权登记。未经登记的地役权，虽然仍然有效，但在对抗善意第三人方面可能会受到限制。
二、土地承包经营权与地役权的关系
土地承包经营权是承包农户对承包土地享有占有、使用、收益和一定处分的权利。土地承包经营权人有权将土地承包经营权互换、转让，甚至用于抵押（但需注意，以家庭承包方式取得的土地承包经营权在特定情形下不得抵押）。当土地承包经营权被抵押时，如果土地上存在地役权，并且该地役权对提升土地承包经营权的价值有重要作用，那么地役权通常会随土地承包经营权一并抵押。
三、地役权与土地承包经营权一并抵押的登记问题
抵押权的设立：地役权与土地承包经营权一并抵押时，抵押权的设立并不以登记为生效要件。抵押权自合同生效时即告设立。然而，为了保障抵押权的对抗效力，当事人通常会选择向登记机构申请抵押登记。
登记的法律效果：如果土地承包经营权已经依法登记，并且地役权也进行了登记，那么地役权的抵押效力将得到更强的法律保障。在发生纠纷时，已登记的地役权能够更有效地对抗善意第三人。
未登记的情况：如果地役权未进行登记，虽然其抵押效力仍然存在（基于合同的生效），但在对抗善意第三人方面可能会受到限制。这意味着，在未经登记的情况下，如果第三人善意取得了与地役权相关的权益，那么原抵押权人可能无法主张其对抗该第三人的权利。
综上所述，地役权与土地承包经营权一并抵押时，并非登记生效，而是自合同生效时设立。然而，为了增强法律效力和对抗性，当事人可以选择向登记机构申请登记。在办理相关手续时，建议咨询专业律师或法律机构以确保合法权益得到妥善保护。