关于“两家合作项目能否把公章带回公司”的问题，首先我们要明确的是，公章作为公司的重要印鉴，其管理和使用通常受到公司内部规章制度以及相关法律法规的严格约束。

核心结论：在两家合作项目中，一般情况下，不建议也不允许将公章带回公司。公章的使用应当遵循双方合作协议的约定，并在合作项目的特定场合和程序下使用。

详细分析：

1. 合作协议约定：两家公司在合作时，通常会签订详细的合作协议，其中应包含关于公章使用、管理以及责任承担等条款。双方应严格遵守这些约定，以确保合作的顺利进行和各自权益的保护。

2. 公章的法定性：公章在公司法中具有特定的法律意义，它代表着公司的意志和行为的确认。因此，公章的使用必须谨慎，并遵循相关法律法规的规定。将公章带回公司可能会引发一系列法律风险和纠纷，如越权使用、伪造文件等。

3. 合作项目的特殊性：在合作项目中，公章的使用往往与项目的进展、资金的划拨、合同的签订等重要事项紧密相关。因此，公章的保管和使用应当更加严格，以确保项目的顺利进行和资金的安全。

4. 建议与措施：

   • 双方应明确公章的使用范围和程序，并在合作协议中予以明确约定。
   • 设立专门的公章管理人员，负责公章的保管和使用记录。
   • 在需要使用公章时，应经过双方同意，并按照约定的程序进行。
   • 定期对公章的使用情况进行检查和审计，以确保其合规性。

综上所述，两家合作项目中的公章使用应当遵循合作协议的约定，并在特定的场合和程序下使用。不建议也不允许将公章带回公司，以避免可能引发的法律风险和纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。