劳动合同中的基本工资和实发工资不一样。以下是对这一问题的详细解释：

一、基本工资与实发工资的概念

1. 基本工资：是劳动合同中明确约定的，劳动者在法定工作时间内提供正常劳动所获得的固定报酬，是工资构成中的一个基础部分。
2. 实发工资：则是劳动者实际到手的工资，它可能包含了基本工资、奖金、津贴、补贴、绩效工资、加班费等所有形式的劳动报酬，并扣除了个人所得税、社保、公积金等法定扣减项以及可能的公司合规扣款。

二、基本工资与实发工资可能不一致的原因

1. 工资构成多样性：如上文所述，实发工资可能包含多个组成部分，而基本工资只是其中的一部分。因此，当存在其他收入项目或扣减项目时，实发工资与基本工资就会不一致。
2. 公司制度或政策调整：公司在运营过程中可能会根据市场情况、经营状况等因素对薪酬制度进行调整，导致实际发放的薪资与合同约定的基本工资不一致。
3. 绩效考核结果：如果劳动合同中约定了绩效工资或奖金等浮动部分，那么实际发放的薪资会根据员工的绩效考核结果进行调整，从而影响实发工资的数额。
4. 加班工资计算差异：对于存在加班情况的员工，加班工资的计算方式及标准可能影响最终到手的薪资总额。
5. 扣除项目变化：如社保公积金基数调整、个人所得税专项附加扣除申报变化等法定扣减项的增加或减少，以及公司新增或取消的合规扣款，都会导致实发工资的变化。

三、劳动者的权益与应对措施

1. 知情权：劳动者有权要求公司就薪资变动提供书面说明，包括调整依据、计算方式及具体金额明细。
2. 核对工资条：每月仔细比对工资条各项收入与合同约定是否相符，重点关注基本工资、绩效奖金、加班费等核心项目。
3. 异议权：若认为薪资核算存在错误，可于收到工资条后合理期限内提出书面异议，要求公司复核并答复。
4. 法律救济权：通过协商无法解决的争议，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张补发差额、经济补偿金等合法权益。

综上所述，劳动合同中的基本工资和实发工资可能因多种原因而不一致。劳动者应了解自己的权益和应对措施，确保自己的合法权益得到妥善保护。如有任何疑问或问题，请直接向我咨询。