合作协议中可以约定违约金。违约金是对违约方的一种惩罚性措施，同时也是对守约方因对方违约所遭受损失的一种补偿方式。合作双方可以根据合作的性质、预期利益、违约可能造成的损失等因素来协商确定违约金的具体数额或计算方式。但需要注意的是，违约金的数额应当合理，不能过高或过低。

1. 违约金的约定：

   • 合作协议中可以明确约定违约金条款，包括违约金的数额、计算方式、支付时间等。
   • 违约金的数额可以是一个固定金额，也可以按合同总金额的百分比计算，或者根据守约方实际损失确定。

2. 违约金的合理性：

   • 如果约定的违约金过高，明显超过实际损失或预期利益，违约方可以请求法院或仲裁机构适当减少违约金数额。
   • 如果违约金过低，不足以弥补守约方的损失，守约方也可以请求法院或仲裁机构适当增加。

3. 违约金的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
   • 约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

4. 撰写违约金条款的建议：

   • 在撰写违约金条款时，应明确违约情形、违约金计算方式、支付时间与方式，并考虑合理性限制。
   • 确保条款符合法律合规性、公平性与可操作性，并建议由专业律师审核。

综上所述，合作协议中可以约定违约金，但违约金的数额应当合理，并根据实际情况进行协商确定。如有任何关于合作协议或违约金的问题，欢迎随时向我咨询。