针对您提出的问题“印章没有盖在指定位置可以废标吗”，以下是对此问题的详细解答：
首先，需要明确的是，在招投标过程中，投标文件的合规性对于投标人来说至关重要。其中，印章的加盖位置和方式往往被视为投标文件是否合规的重要依据之一。
从一般的招投标规定来看，如果投标文件未按照招标文件的要求在指定位置加盖单位印章或签字，那么这份投标文件很可能会被视为无效或废标。这是因为，招标方通常会在招标文件中明确规定投标文件的签署和盖章要求，包括盖章的具体位置、盖章的种类（如单位章、法人章等）以及签字的要求等。投标人必须严格遵守这些规定，以确保投标文件的合规性。
然而，在实际操作中，是否会因为印章未盖在指定位置而废标，还需要考虑以下几个因素：
招标文件的明确性：如果招标文件中对印章加盖位置的要求非常明确，且没有给出任何灵活处理的空间，那么投标人必须严格按照要求执行。否则，一旦被发现印章未盖在指定位置，就很可能会导致废标。
评标委员会的裁决：在招投标过程中，评标委员会负责评审投标文件并作出是否废标的决定。如果评标委员会认为印章未盖在指定位置属于重大违规，且对投标文件的真实性和有效性产生质疑，那么他们可能会裁定该投标文件废标。
相关法律法规和惯例：在某些情况下，相关法律法规或行业惯例可能会对印章加盖位置的要求产生一定影响。例如，某些法律可能规定印章必须加盖在特定位置才具有法律效力。如果投标人违反这些规定，也可能会导致废标。
综上所述，印章没有盖在指定位置确实存在废标的风险。因此，投标人在准备投标文件时，必须仔细阅读招标文件中的相关规定，并严格按照要求执行。如果确实因为某种原因无法在指定位置加盖印章，应及时与招标方沟通并寻求解决方案，以避免因此而导致废标。
此外，从您提供的政府采购投诉处理决定书案例中也可以看出，印章加盖位置的问题在实际操作中确实可能引发争议和投诉。因此，投标人应更加重视投标文件的合规性，确保所有手续和文件都符合招标方的要求。