在行政诉讼中，确认行政协议无效不受起诉期限的限制。以下是对此结论的详细阐述：

1. 司法实践与争议：

   • 在当前司法实践中，行政协议的当事人向法院起诉确认行政机关与其签订的行政协议无效的案件日益增多。对于这类案件，是否应当受《行政诉讼法》规定的起诉期限限制，法律界一直存在争议。

2. 最高人民法院的表态：

   • 最高人民法院在相关答复中倾向于认为，提起确认行政行为无效之诉不受起诉期限的限制。行政相对人可以在任何时候请求有权国家机关确认该行为无效。这一观点体现了对无效行政行为自始无效特征的认识，即无效行政行为不可能通过期限被耽误而获得“确定力”。

3. 司法解释的定分止争：

   • 《最高人民法院关于审理行政协议案件若干问题的规定》间接地回应了这一问题。该规定指出，对行政机关变更、解除行政协议等行政行为提起诉讼的，起诉期限依照行政诉讼法及其司法解释确定；而对于行政相对人起诉确认行政协议无效，则应当参照适用《民事诉讼法》关于诉讼时效的规定。《民事诉讼法》关于合同相对人起诉确认合同无效的诉讼时效是无期限限制的，因此，行政相对人起诉确认行政协议无效没有期限限制（当然，在司法实践中行政相对人的起诉时间不宜人为拖得太长）。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 虽然确认行政协议无效不受起诉期限的限制，但当事人在提起诉讼时仍需注意相关证据的收集和保存，以确保能够充分证明行政协议的无效性。
   • 同时，当事人也应注意诉讼的及时性和合理性，避免不必要的拖延和滥用诉权。

综上所述，行政诉讼中协议无效的确认不受起诉期限的限制。这一结论既符合法律原理，也体现了对当事人合法权益的保护。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。