合同分协议书、专用条款，没有通用条款是不可以的。在施工合同纠纷中，通用条款通常作为招标文件的一部分提供给投标人，无论是否执行通用条款，它都应作为合同的一个组成部分予以保留，不应只把协议书和专用条款作为合同的全部内容。

从法律角度来看，《民法典》第四百六十五条明确规定了依法成立的合同受法律保护，而合同的条款是构成合同内容的重要组成部分。通用条款虽然可能不是每个合同都必须完全照搬的内容，但它提供了合同双方应遵循的一般原则和规则。当合同双方对特定事项没有约定或约定不明时，通用条款可以作为补充和解释的依据。

因此，在签订合同时，建议合同双方应充分考虑并包含通用条款，以确保合同的完整性和合法性。如果合同确实没有包含通用条款，而双方又因此发生争议，那么应根据合同的相关条款、性质、目的以及诚信原则等予以解释和处理。

总之，为了确保合同的合法性和有效性，避免潜在的纠纷和风险，建议在合同中同时包含协议书、专用条款和通用条款。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。