在行政诉讼中，涉及国家秘密的证据质证是一个特殊且重要的环节。根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，我为您详细解析这一过程：
一、质证的基本原则
在行政诉讼中，证据应当在法庭上出示，并由当事人互相质证。这是质证的基本原则，旨在确保双方当事人都有机会对对方提出的证据进行质询和解答，从而揭示案件的事实真相。
二、涉及国家秘密证据的特殊处理
然而，对于涉及国家秘密、商业秘密和个人隐私的证据，法律有特别的规定。这类证据不得在公开开庭时出示，以防止敏感信息的泄露。这是为了保护国家的安全利益、企业的商业秘密以及个人的隐私权。
三、质证的具体操作
非公开质证：对于涉及国家秘密的证据，法院会安排非公开的方式进行质证。这可能包括在闭庭状态下进行，或者通过其他保密措施确保信息不被泄露。
法院的全面、客观审查：即使证据不在公开开庭上出示，人民法院仍然需要按照法定程序，全面、客观地审查核实这些证据。法院会仔细评估证据的真实性、合法性和关联性，以确保其能够作为认定案件事实的根据。
裁判文书中的说明：对于未采纳的证据，人民法院应当在裁判文书中说明理由。这既是对当事人权益的保障，也是对法院裁判过程的公开和透明化。
四、非法证据的排除
值得注意的是，以非法手段取得的证据，不得作为认定案件事实的根据。这是法律对证据合法性的严格要求，旨在防止通过不正当手段获取的证据对案件判决产生不公正的影响。
综上所述，行政诉讼中涉及国家秘密的证据质证是一个严谨且保密的过程。法院会依法保护国家秘密不被泄露，同时确保当事人有充分的质证权利，并全面、客观地审查核实证据，以作出公正的判决。