事业单位聘用人员违反纪律处分的依据主要是《事业单位工作人员处分暂行规定》以及其他相关的法律法规，如《中华人民共和国公职人员政务处分法》和《事业单位人事管理条例》等。这些规定构成了一个完整的法律体系，为处理违纪行为提供了明确的指导。

根据这些规定，处分种类包括警告、记过、降低岗位等级或者撤职、以及开除，每种处分都对应着不同的违纪行为和严重程度。同时，处分的决定权通常由事业单位或其主管部门根据干部人事管理权限来行使，其中开除处分需要报同级事业单位人事综合管理部门备案。

在实际操作中，对于违纪行为的处理会遵循公正、公平、惩治与教育相结合的原则，确保事实清楚、证据确凿、定性准确、处理恰当、程序合法、手续完备。被处分人员也享有申诉的权利，可以在规定时间内提出申诉，以保障其合法权益。

总的来说，事业单位聘用人员违反纪律的处分依据是一个系统且严谨的法律体系，旨在维护事业单位的秩序和纪律，促进工作人员的廉洁从业和职业操守。